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domenica 28 novembre 2010

Random Ammino Acids Abbreviations Generator

I have to learn amino acids abbreviations for my Proteomic exams.
Therefore I created a very simple script that gives me, every time I start it, the amino acid abbreviation.
So, when I read it, I can write its structure on my paper.
This is the bookmarklet: AA abbreviation generator.

If you want to make it 'interactive' to have a feedback if you guessed right, I made this other bookmarklet: AA Abbreviation name Quiz.

Bouns: pKi(-COOH) quiz

mercoledì 10 novembre 2010

[How To] Watch Filmon.com streaming on Linux

Maybe you already know this http://www.filmon.com
Until it will last, it broadcasts some international tv channels (BBC, CNN, CBS...and porn as well).
It works "software-less" on iPad, iPhone and Android.
On Windows it need a software (downloadable from the site itself) and on Linux you can run it with Wine with no problems.
But I didn't want to use it because it requires too CPU work therefore I thought about a workaround (works only on Firefox since on Chrome you can't change your user agent) and the principle on which it is based is to emulate the browser of Google Nexus One.


Follow these steps:

  1. Install the extension User Agent Switcher and reload Firefox 
  2. From Tools Menu search for something like "Default User Agent"
  3. Click on "Edit User Agent"
  4. Click on "New", then on "New User Agent..."
  5. In "Description" field write whatever you want (e.g. Google Nexus One)
  6. In "User Agent" paste this string: "Mozilla/5.0 (Linux; U; Android 2.1; en-us; Nexus One Build/ERD62) AppleWebKit/530.17 (KHTML, like Gecko) Version/4.0 Mobile Safari/530.17" (without quotes of course)
  7. Empty other fields and click Ok
  8. Now go on http://www.filmon.com and choose the channel you want to see
  9. Choose Totem or VLC as software to reproduce the stream
  10. Enjoy!

martedì 2 novembre 2010

Medioman

Non mi scandalizzo di quello che ha detto B oggi, cosa c'è di nuovo/strano?
La cosa triste, e vi invito a contraddirmi, è che se vi guardate intorno, dal tabaccaio all'autista del bus, quanti non la pensano esattamente allo stesso modo?

mercoledì 18 agosto 2010

Cos'è un PhD?

PhD sta per Philosophiæ Doctor e può essere tradotto con il termine italiano di Dottore di Ricerca.
Per capire bene cosa significhi ho pensato di tradurre in italiano un'affascinante quanto semplice e diretta presentazione fatta dal Prof. Matt Might, docente di Computer Science presso l'Università dello Utah.
Segue la traduzione  dall'originale (The Illustrated Guide to a Ph.D.)

Ogni autunno, spiego ad un nuovo gruppo di studenti dottorandi cosa il dottorato sia.

È difficile descriverlo a parole.

Perciò, io uso le immagini.

Leggi sotto la guida illustrata al dottorato di ricerca.

Immagina un cerchio che contenga tutta la conoscenza umana:


Nel momento in cui finisci la scuola elementare, tu ne conosci un po':


Quando finisci la scuola superiore, ne sai un po' di più:

Con una Laurea Triennale acquisisci una specialità:

Una Laurea Specialistica approfondisce questa specialità:

Leggere pubblicazioni scientifiche ti porta al bordo della conoscenza umana:

Una volta arrivato al limite, metti a fuoco:

Spingi al limite per alcuni anni:

Finché un giorno il confine cede:


E, quell'ammaccatura che avete prodotto si chiama dottorato di ricerca (PhD):

Naturalmente, il mondo vi sembrerà diverso ora:

Perciò, non dimenticate l'immagine più grande:
Continuate a spingere.

giovedì 22 aprile 2010

DNA Reverse Complement with Ubiquity for Firefox

Due to my lazyness and headcache staring at the monitor to create a reverse complement of a DNA strand, I create a simple Ubiquity command which does it for you.
It is easy to use:
  • select the DNA strand in plain text format (I preferably use this command for Primer3)
  • activate Ubiquity (usually CTRL + Space)
  • write the command revcomp
  • you will see the reverse-complement counterpart of the DNA sequence you selected
  • to copy it just press enter and it will be copied in your clipboard
It is also possible to use it without selecting a sequence but writing it directly into Ubiquity.

To see the help, just write in Ubiquity: help revcomp

Install it: click here.

lunedì 8 febbraio 2010

L'inquietante fascino dei parassiti


Sto studiando per l'esame di parassitologia e rimango sempre più colpito e affascinato dai cicli biologici che questi hanno: astuti stratagemmi che questi compiono creando inganni, finzioni e attirando in una trappola mortale i loro ospiti in cui si replicano e aspettano di infestarne un altro disperdendosi continuamente come uova o larve.

Certo, parlando così si sbaglia, si ricama e si guarda con l'occhio finalistico. In realtà la larva che invade il cervello della formica espandendosi alla sera poiché sensibile all'umidità, comprimendone i gangli nervosi e lasciandola paralizzata fino alla mattina successiva e facendo sì che questa non possa tornare nel formicaio ma essere mangiata dai ruminanti che sono gli ospiti definitivi della larva non è stato un ciclo così imposto dalla natura.
Tutto è fatto con il metodo del "prova e sbaglia" finché le condizioni renderanno la prova vincente. Questo è il meccanismo con il quale l'evoluzione ha creato e continua a creare tutto ciò, noi così come quei piccoli parassiti.
L'astuzia del suo ciclo è una qualità vista dall'uomo, per la natura quello è il migliore che massimizza l'efficienza di trasmissione.

Tempo fa mi era capitato di guardare una gallery interessantissima sul sito de LeScienze (da cui l'immagine sopra) che può darvi un'idea di tutto un mondo sommerso che molti di voi non conosceranno e pertanto invito a guardare.

venerdì 15 gennaio 2010

Come fare una canzone rap

Aprite questi (http://www.youtube.com/watch?v=QLx60TZ9_T8 e http://www.youtube.com/watch?v=65ea873fF2Y) due video contemporaneamente o cliccate semplicemente qui.

(via catastrofe)

mercoledì 6 gennaio 2010

[HOWTO] Tradurre al volo parole (o espressioni gergali) dall' inglese con Firefox

Se non avete installato Ubiquity, fatelo ora.
È inutile che vi spieghi a cosa serva, basta cercarlo con google e troverete caterve di guide.

Installate il comando per wordreference che troverete qui: http://thomas-genin.com/projects/ubiquity/ubiquity-wordreference

Dopo di che ogni qual volta ci sarà un termine che non conoscete basterà:
  1. Selezionare la parola
  2. Attivare Ubiquity (il comando dipende da quello che avete settato, io ad esempio uso CTRL+Space)
  3. Scrivere wr this to ita from eng (delle volte basterà solo scrivere fino a ita perché capisce in automatico la lingua di origine)
Osserverete la ricca descrizione fornita dall'utilissimo WordReference.
In questo esempio ho dato per scontato che stiate traducendo dall'inglese ma guardando sul sito di wordreference potrete vedere le altre lingue disponibili.

Per le espressioni gergali invece ci baseremo su UrbanDictionary, sito che raccoglie tutte le espressioni gergali della lingua inglese.
Lo script lo potete installare da questo indirizzo: http://common-lisp.net/project/lifp/ubiquity/urban-dictionary.htm
e la procedura sarà simile a quella precedente (e quindi di tutti i comandi ubiquity) solo che il comando si attiva scrivendo: urban this (o anche solo urban).

martedì 5 gennaio 2010

[HOWTO] Come leggere più facilmente al pc evitando dei gran mal di testa

Con Readability potrete modificare attraverso un semplice bookmarklet il layout di pagine web che richedono un notevole sforzo di lettura.
Vi basterà andare alla pagina linkata e scegliere il layout che più vi aggrada (dimensione caratteri, margini, tipologia di sfondo) potendo valutare l'effetto in tempo reale delle diverse modifiche e successivamente trascinare il bookmarklet nella vostra barra dei segnalibri di Firefox.
Pagina di Setup di Readability
Quando vorrete leggere dei lunghi testi vi basterà cliccare sul bookmarklet e la pagina si convertirà assumendo il layout precedentemente settato.
Vi assicuro che è di una comodità incredibile.

Esempio di testo modificato con Readable
Nel caso in cui voleste leggere dei testi brevi, diciamo "al volo", potrete fare affidamento su di un altro sito (Readable) che ha un funzionamento simile al precedente con la differenza che il testo modificato appare al centro dello schermo in sovra-impressione (guardate l'immagine qui sopra per capire cosa intendo).
Inoltre Readable permette una più fine customizzazione del layout.


(via Lifehacker che dà tutta una serie di utili consigli in tal senso)


venerdì 1 gennaio 2010

[HOWTO] Come creare tag cloud in Blogger

Se vi piace la visualizzazione dei tag con una tag cloud (letteralmente nuvola di tag) come potete vedere nella colonna di destra e utilizzate anche voi blogger seguite questi semplici passi:
  1. Andate nella scheda Layout
  2. Aggiungete il gadget Labels
  3. Scegliete come visualizzazione Nuvola
  4. Togliete la spunta da Mostra il numero di post per etichetta
  5. Salvate